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地區年齡性別統計表-日本腦炎
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：日本腦炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-傷寒
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：傷寒，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-中東呼吸症候群冠狀病毒感染症
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：中東呼吸症候群冠狀病毒感染症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-流行性腦脊髓膜炎(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：流行性腦脊髓膜炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-急性病毒性Ａ型肝炎
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：急性病毒性Ａ型肝炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-梅毒
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：梅毒，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-急性病毒性C型肝炎
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：急性病毒性C型肝炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-西尼羅熱
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：西尼羅熱，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-德國麻疹
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：德國麻疹，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-鼠疫
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：鼠疫，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-兔熱病
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：兔熱病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-肉毒桿菌中毒
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：肉毒桿菌中毒，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
急診傳染病監測統計-急性腹瀉
各縣市、年齡別及年週之急性腹瀉急診就診人次統計表 -
地區年齡性別統計表-HIV感染(含母子垂直感染疑似個案)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：HIV感染，日期種類：診斷日，病例種類：確定病例，感染來源：本國籍、非本國籍) -
地區年齡性別統計表-李斯特菌症
2017年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：李斯特菌症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-炭疽病(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：炭疽病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-霍亂(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：霍亂，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-狂犬病
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：狂犬病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-流行性斑疹傷寒
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：流行性斑疹傷寒，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-多重抗藥性結核病(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：多重抗藥性結核病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入)
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