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結核病－新案發生數統計(縣市別、性別、年齡別)
因結核病個案採疑似即通報，須進行數月長期追蹤，方得確認是否為確診結核病或排除診斷。因此結核病年度統計資料固定於每年底更新前一年之全年度統計值。- CSV
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結核病－每日追蹤管理中個案統計
縣市別、鄉鎮別、日期別 ( 各項分群指標：如確診、性別、年齡、細菌學陽性... -
結核病－多重抗藥結核病個案數統計
因結核病個案採疑似即通報，須進行數月長期追蹤，方得確認是否為確診結核病或排除診斷。因此結核病年度統計資料固定於每年底更新前一年之全年度統計值。- CSV
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地區年齡性別統計表-嚴重特殊傳染性肺炎-依發病日統計(以日為單位)
2020年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：嚴重特殊傳染性肺炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：是否為境外移入)。本資料集每日依系統固定排程更新一次，呈現截至前一... -
地區年齡性別統計表-登革熱-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：登革熱，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-新型A型流感-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：新型A型流感，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-裂谷熱-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：裂谷熱，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-馬堡病毒出血熱-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：馬堡病毒出血熱，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-拉薩熱-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：拉薩熱，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-伊波拉病毒感染-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：伊波拉病毒感染，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-黃熱病-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：黃熱病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-中東呼吸症候群冠狀病毒感染症-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：中東呼吸症候群冠狀病毒感染症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-布氏桿菌病-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：布氏桿菌病，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-弓形蟲感染症-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：弓形蟲感染症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-疱疹B病毒感染症-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：疱疹B病毒感染症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-侵襲性肺炎鏈球菌感染症-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：侵襲性肺炎鏈球菌感染症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-水痘併發症-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：水痘併發症，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-急性病毒性C型肝炎-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：急性病毒性C型肝炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-急性病毒性D型肝炎-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：急性病毒性D型肝炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入) -
地區年齡性別統計表-急性病毒性E型肝炎-依發病日統計(以週為單位)
2003年起各地區、各年齡層、性別之病例數統計表(疾病名稱：急性病毒性E型肝炎，日期種類：發病日，病例種類：確定病例，感染來源：本土、境外移入)
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