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2016年病原微生物基因資料庫腸病毒/流感序列流病資料表
2016年腸病毒與流感病毒核甘酸與胺基酸序列資料，及對應流病資料。能以國內所發生縣市區域來呈現，序列資料能讓署內外研究人員有進一步研究成效。- CSV
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2017年病原微生物基因資料庫腸病毒/流感序列流病資料表
2017年腸病毒與流感病毒核甘酸與胺基酸序列資料，及對應流病資料。能以國內所發生縣市區域來呈現，序列資料能讓署內外研究人員有進一步研究成效。- CSV
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健保門診及住院就診人次統計-腸病毒
各縣市、年齡別、年週之腸病毒門診及住院就診人次統計表 -
健保門診及住院就診人次統計-猩紅熱
各縣市、年齡別、年週之猩紅熱門診及住院就診人次統計表 -
登革熱近12個月每日確定病例統計
近12個月每日登革熱確定病例統計，資料更新頻率為每日更新 -
健保門診及住院就診人次統計-腹瀉
各縣市、年齡別、年週之腹瀉門診及住院就診人次統計表 -
健保門診及住院就診人次統計-疱疹性咽峽炎
各縣市、年齡別、年週之疱疹性咽峽炎門診及住院就診人次統計表 -
急診傳染病監測統計-疱疹性咽峽炎
各縣市、年齡別及年週之疱疹性咽峽炎急診就診人次統計表 -
結核病－新案發生數統計
縣市別、年別 ( 發生數、性別發生數、年齡別發生數 )- CSV
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